Que préfère-t-il?
Qu'aime-t-il manger par dessus tout? / Quel est son plat préféré?
préférer qqch à autre chose / préférer faire par dessus tout

C'est difficile de traduire littéralement. Je crois que le verbe "préférer" pour opposer deux chose est idéal pour exprimer le comparatif.
L'expression "par dessus tout" quant à elle exprime bien le superlatif.

Qu'est-ce qu'il aime?
Qu'est-ce qu'il aime mieux?
Qu'est-ce qu'il aime le plus?

Qu'est-ce qu'il aime! je dirais que c'est "was mag er?" sans le "lieber"