I'm pretty sure it means the top floor flat/apartment.

Wohnung Nr. 2 in der ober(st)en Etage?

Yes, there should be two or more flats/apartments on the top floor. In the land register (Grundbuch), it will be identified as no. 2. Probably has a nice balcony as well.

well I don't know if the flat is really on the top floor, since the address of the flat is XXXstrasse .... im Erdgeschoss.... :(

Top ist in Österreich eine gebräuchliche Bezeichnung für Wohnung (eher bei Neubauten verwendet).

Hat also nichts mit Stockwerk o. ä. zu tun, ist einfach die Türnummer oder Wohnungsnummer.

Beispiel hier:
http://www.thaler-immobilien.com/objekte/brun...

It's that easy.....thanks a lot Sir Pooh de Bear

Also auf gut Deutsch, äh, Österreichisch dann "Wohnung Wohnungsnr. 2"?

Es ist eine absolut übliche Bezeichnungen für Wohnungen/Büros aller Art in AT. Es entspricht "Wohnungsnummer", "Türnummer", wobei "Wohnungsnummer" keiner in AT sagt, da es für ALLE ARTEN Objekte, sei es vermietbare, verpachtbare oder Eigentum, verwendet wird, solange sie irgendwo in einem Gebäude sind.
Abgekürzt wird das in der Regel "t." oder "T.", meistens aber ausgeschrieben.
Weitere Infos, auch ein Austriazismus: "Stiege" in einer Adresse bedeutet einen GEBÄUDETEIL mit eigenem Stiegenaufgang/Treppenhaus, der meist separat zu begehen ist. (in der Regel Neubauten, es gibt aber auch alte Gebäude mit mehreren Stiegen)

Adresse: Stadtstraße 2/2/2/12 heißt übersetzt: Nummer 2, Stiege 2, 2. Stock, Top 12
Adresse: Stadtstraße 2/2/12 heißt: Nummer 2, 2. Stock, Top 12
meistens steht aber einfach nur: Stadtstraße 2/12: also Nummer 2, Top 12